Geliat pembangunan disuatu wilayah tidak terlepas dari dukungan lembaga keuangan (bank) untuk menjamin kelancaran perputaran roda perekonomian di suatu wilayah. Kabupaten Wakatobi sebagai salah satu daerah otonom baru telah didukung sektor perbankan yang cukup memadahi, di Wakatobi sampai dengan tahun 2013 tercatat 6 lembaga keuangan (bank) yang telah beroperasi yaitu:
- Bank BPD Sultra,
- Bank BRI,
- Bank BNI 46,
- Bank Banamon,
- Bank BPR Bahteramas, dan
- BMT Mukamalat
Hampir semua bank yang ada telah dilengkapi dengan fasilitas ATM dan Maney Changer.
Bahkan BPD telah memperluas pelayanannya dengan membuka Kantor Kas Usuku di Pulau Tomia.